Seit mehr als 40 Jahren ist WERGO ein Synonym für ein Programm zeitgenössischer Musik in anspruchsvollen Präsentationsformen. Neben solistischen, kammermusikalischen und orchestralen Einspielungen der neuen Musik zählen hierzu auch Veröffentlichungen von Werken der elektronischen Musik, der unter dem Begriff Ars Acustica firmierenden radiofonen Formen und der neueren Entwicklungen, die sich zwischen den Künsten abspielen.

In besonderer Weise nimmt sich WERGO darüber hinaus der Dokumentation der vielfältigen aktuellen wie historisch gewordenen weltmusikalischen Erscheinungen und der Dokumentation jüdischer Lebenswelten an.

Unter dem Dach von WERGO sind verschiedene Serien und Sublabels vereint (Näheres s. Programm).